More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1781 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.62 
 
 		 186 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.62 
 
 		 186 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.62 
 
 		 186 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  77.42 
 
 		 186 aa  291  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.68 
 
 		 186 aa  289  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.73 
 
 		 185 aa  280  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  73.58 
 
 		 170 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.6 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.78 
 
 		 175 aa  231  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.47 
 
 		 180 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.44 
 
 		 180 aa  230  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  72.33 
 
 		 171 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  67.92 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.47 
 
 		 180 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.9 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  65.71 
 
 		 187 aa  224  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.28 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.52 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  69.81 
 
 		 171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.67 
 
 		 190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.87 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.67 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.86 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.06 
 
 		 190 aa  210  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.25 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  67.09 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.64 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.64 
 
 		 190 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  66.46 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.25 
 
 		 172 aa  208  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  66.46 
 
 		 180 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  66.46 
 
 		 180 aa  204  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  65.82 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.52 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.49 
 
 		 172 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  63.92 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.7 
 
 		 163 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.33 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.06 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.7 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  55.41 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.43 
 
 		 163 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.8 
 
 		 163 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.17 
 
 		 165 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.9 
 
 		 168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  49.36 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 		 163 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  47.8 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  47.8 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  45.22 
 
 		 163 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.36 
 
 		 182 aa  138  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.36 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  42.5 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  47.2 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 		 163 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.12 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0418826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>