More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1767 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  100 
 
 		 179 aa  361  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  68.39 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  64.8 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  64.8 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  64.25 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  68.39 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  53.14 
 
 		 198 aa  180  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  50.57 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  48.3 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  49.09 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  54.09 
 
 		 197 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  48.82 
 
 		 193 aa  167  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  47.4 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  47.7 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  49.4 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  47.67 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  47.67 
 
 		 193 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  49.43 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  49.4 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  47.09 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  47.09 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  47.09 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  46.55 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  47.34 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  48.41 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  47.02 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  48.52 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  42.77 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  42.77 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  47.77 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  46.5 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  52.91 
 
 		 189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  50.31 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  49.06 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  45.56 
 
 		 195 aa  161  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  50.31 
 
 		 195 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  50.31 
 
 		 195 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  46.5 
 
 		 200 aa  160  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  48.52 
 
 		 193 aa  160  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  46.41 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  50.94 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  47.4 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  45.24 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  43.12 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  51.52 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  45.88 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  46.54 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  46.47 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  46.06 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  45.24 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  50.31 
 
 		 197 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  45.86 
 
 		 235 aa  157  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  48.39 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  46.55 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  46.55 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0990  hypothetical protein  48.43 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  47.67 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  49.69 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  46.54 
 
 		 211 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  48.05 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  47.17 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  49.06 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  41.34 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  50.31 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  47.88 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  44.64 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  44.64 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  43.27 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  45.98 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  45.76 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  48.75 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  43.6 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  43.6 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  45.22 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  47.09 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  41.71 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  44.57 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  45.28 
 
 		 201 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  44.38 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  44.19 
 
 		 217 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  41.95 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  41.86 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  51.72 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  42.33 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  44.83 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  44.05 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  46.43 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  45.81 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  46.06 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  40.35 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1984  hypothetical protein  37.21 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  44.19 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  42.05 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>