More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1111 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2215  hypothetical protein  57.63 
 
 		 211 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.548761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  55.93 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  54.19 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  58.05 
 
 		 210 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  54.44 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  54.64 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1232  hypothetical protein  54.19 
 
 		 201 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  54.1 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0439  hypothetical protein  52.46 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  52.46 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  50.84 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1637  hypothetical protein  53.45 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  54.24 
 
 		 199 aa  200  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  53.67 
 
 		 200 aa  200  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0551  hypothetical protein  51.37 
 
 		 217 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5283  hypothetical protein  54.95 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  normal  0.256831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4743  hypothetical protein  51.61 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0460  hypothetical protein  51.67 
 
 		 197 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5210  hypothetical protein  51.06 
 
 		 200 aa  197  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.329451  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  53.33 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4183  hypothetical protein  56.5 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  51.93 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0139  hypothetical protein  48.59 
 
 		 217 aa  191  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1931  hypothetical protein  49.16 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0402475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  47.46 
 
 		 201 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1911  hypothetical protein  50.83 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.863211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  44.44 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2020  hypothetical protein  44.51 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  48.21 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  47.16 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  49.38 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  49.38 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  47.31 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  46.86 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  49.36 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  47.88 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  42.54 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  48.48 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  44.69 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  46.89 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  44.07 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  48.77 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  45.71 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  45.71 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  43.58 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3285  hypothetical protein  47.7 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  41.86 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1392  hypothetical protein  42.11 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  47.5 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0978  hypothetical protein  41.67 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.327238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  45.09 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  44.38 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  49.38 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  42.86 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  46.15 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  45.86 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0335  decarboxylase family protein  41.04 
 
 		 188 aa  160  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  44.44 
 
 		 196 aa  159  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  43.17 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  46.45 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  40.35 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4702  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0704  hypothetical protein  41.48 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0720  hypothetical protein  41.48 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00620883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  40.88 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  40.88 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  46.75 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  42.05 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  46.75 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  47.46 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2052  hypothetical protein  51.96 
 
 		 206 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0920223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  42.69 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  43.1 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  43.35 
 
 		 193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  48.57 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  46.95 
 
 		 337 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  46.41 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1214  hypothetical protein  41.62 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1920  hypothetical protein  40.57 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2689  hypothetical protein  48.57 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0257204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  42.08 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1143  hypothetical protein  40.11 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  45.45 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  43.83 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>