More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1704 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 168 aa  347  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  53.93 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  44.85 
 
 		 225 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  37.33 
 
 		 505 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  35.93 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.13 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  37.67 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  39.04 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  37.86 
 
 		 504 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  41.38 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.95 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40.97 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.93 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  31.08 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.53 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.53 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.53 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  39.22 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.67 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.67 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  36.73 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.67 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  42.07 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  42.07 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  34.11 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  34.81 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.56 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36.11 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.25 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  32.54 
 
 		 506 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.17 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36.11 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35.83 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  35.83 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35.83 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.69 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.83 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  37.74 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  38.62 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  34.53 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  33.54 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  34.59 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  34.68 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  42.39 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  42.39 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  34 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  36.55 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  36.55 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  40.6 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  36.55 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  36.55 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  35.14 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  36.55 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.48 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  30.94 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.1 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  35.53 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36.48 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  36.55 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  36.81 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  33.33 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  30.46 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  30.46 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  51.61 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  34.36 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  33.58 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  31.69 
 
 		 497 aa  65.5  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  34.23 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  33.33 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  34.23 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>