More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0862 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0862  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.353594  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2112  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
176 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0273695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1856  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.28 
 
 
174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
179 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0247566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1440  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.69 
 
 
183 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
176 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.037759  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2547  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
183 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.49891e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
180 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1422  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
175 aa  160  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351184  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
181 aa  157  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
177 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
189 aa  154  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
170 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
181 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
182 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  43.02 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
179 aa  151  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
174 aa  151  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
184 aa  151  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
188 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
175 aa  150  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
176 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
176 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
179 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
183 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
178 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
169 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
183 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
176 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1423  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
177 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0177502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
178 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
178 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
178 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
180 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
182 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
181 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
181 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
182 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  42.51 
 
 
178 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
181 aa  147  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
176 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
183 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
178 aa  144  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0566  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0161542  hitchhiker  0.00589759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
176 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
175 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
177 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0084  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
179 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
180 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
190 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
184 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
177 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
178 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
177 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
186 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
175 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
176 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>