More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1534 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
297 aa  584  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
519 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
525 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
452 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
644 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
598 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0365  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.87 
 
 
548 aa  195  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 
564 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
519 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 
565 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1963  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
539 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
660 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  37.16 
 
 
650 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  37.16 
 
 
650 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  37.16 
 
 
660 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
530 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
571 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  36.86 
 
 
660 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
679 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  36.86 
 
 
660 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 
660 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 
650 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
542 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
661 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 
571 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  34.74 
 
 
660 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 
660 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  34.74 
 
 
660 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  36.83 
 
 
660 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  36.83 
 
 
660 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.01 
 
 
588 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 
660 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
639 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 
660 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  34.74 
 
 
660 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.74 
 
 
650 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 
658 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 
660 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.74 
 
 
588 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.53 
 
 
660 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 
596 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.44 
 
 
500 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.22 
 
 
658 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 
417 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
658 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  35.22 
 
 
658 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 
520 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 
660 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
528 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  35.52 
 
 
658 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
542 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
528 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
572 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
626 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 
557 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.52 
 
 
636 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 
678 aa  155  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
417 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  35.95 
 
 
660 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
525 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
388 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
533 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 
660 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 
660 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 
660 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 
660 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 
660 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
573 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
541 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
572 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.13 
 
 
539 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  35.65 
 
 
660 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
621 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 
547 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  36.42 
 
 
540 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 
671 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 
661 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 
549 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
545 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 
528 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.45 
 
 
549 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.22 
 
 
633 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  35.37 
 
 
392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  34.85 
 
 
689 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
547 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 
540 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 
541 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 
540 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 
540 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
420 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
664 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.56 
 
 
503 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
392 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 
544 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
619 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>