More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2648 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.33 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.62 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  29.37 
 
 		 395 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  33.57 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.1 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.45 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.86 
 
 		 397 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  31.21 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  33.06 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  32.41 
 
 		 878 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  33.06 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  32.41 
 
 		 878 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 		 402 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.45 
 
 		 400 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 571 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 571 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  34.31 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.46 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  38.82 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  34.31 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  31.54 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.18 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.18 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  36.21 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 401 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  34.02 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 397 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  34.23 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  34.48 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  35.34 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  25.87 
 
 		 584 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.18 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 421 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  38.1 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  35.34 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 		 585 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 576 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  35.34 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  25 
 
 		 404 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  34.38 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  34.38 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 425 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  28.28 
 
 		 407 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.87 
 
 		 407 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 		 400 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  36.67 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  34.38 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 		 404 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  35.34 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  43.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  26.53 
 
 		 409 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  35.23 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  34.48 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  33.62 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 387 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  25.69 
 
 		 600 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 387 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 407 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  35.56 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.53 
 
 		 573 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  35.56 
 
 		 173 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 392 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  25.68 
 
 		 613 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 395 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 395 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.93 
 
 		 573 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  30.69 
 
 		 574 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  33.91 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 387 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.93 
 
 		 573 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  38.75 
 
 		 237 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  27.08 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  25.34 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  35.56 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 395 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>