190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0340 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.33 
 
 
144 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  31.41 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  31.65 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
399 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.33 
 
 
399 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.1 
 
 
878 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 
402 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.1 
 
 
878 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.34 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 
406 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.86 
 
 
397 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.51 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
405 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
397 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
402 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  29.86 
 
 
402 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
387 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.99 
 
 
504 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  27.78 
 
 
418 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  30.46 
 
 
378 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.65 
 
 
423 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
391 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
387 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
387 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  33.01 
 
 
431 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
401 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  29.79 
 
 
584 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
396 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 
396 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
407 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
479 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  26.53 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.87 
 
 
498 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 
392 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
396 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 
425 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  28.97 
 
 
574 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.47 
 
 
499 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.08 
 
 
493 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
399 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 
387 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
482 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.57 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.32 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
421 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  29.29 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  30.46 
 
 
569 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.29 
 
 
396 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  31.07 
 
 
409 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.87 
 
 
503 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  26.57 
 
 
404 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 
387 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.78 
 
 
392 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  32.61 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
400 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.87 
 
 
494 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  32.61 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  27.46 
 
 
500 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.17 
 
 
505 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.14 
 
 
405 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  28.37 
 
 
404 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  27.89 
 
 
616 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.58 
 
 
573 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.17 
 
 
407 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  31.88 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
396 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  28.57 
 
 
613 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  29.93 
 
 
597 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  31.18 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
397 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
571 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
402 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  28.48 
 
 
485 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
571 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  31.16 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
395 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
395 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
395 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
397 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  28.45 
 
 
884 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>