167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0163 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  100 
 
 		 145 aa  286  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  52.45 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  49.65 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  49.31 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  43.75 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  45.14 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  48.63 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.55 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  45.24 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  39.16 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  39.16 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.9 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  32.88 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  32.88 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  36.22 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  31.97 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.87 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.33 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  36.73 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  36.73 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  36.73 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  33.33 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  31.97 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  36.73 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  30.82 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  31.29 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.53 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  30.14 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 400 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 399 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  31.08 
 
 		 409 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.29 
 
 		 431 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  28.77 
 
 		 403 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 387 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  32.22 
 
 		 170 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.95 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  37.08 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 421 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  30.88 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  40 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 396 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  25.33 
 
 		 584 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  29.85 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 387 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.34 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 571 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28.19 
 
 		 878 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28.19 
 
 		 878 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 571 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.45 
 
 		 573 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.25 
 
 		 585 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.36 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  38.33 
 
 		 190 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.33 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 397 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  27.21 
 
 		 570 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.89 
 
 		 573 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  30.21 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.89 
 
 		 573 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  28 
 
 		 593 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  28.67 
 
 		 600 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.67 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2532  putative flavoprotein  26.03 
 
 		 597 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 264 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  27.33 
 
 		 404 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  28.29 
 
 		 600 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 395 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 576 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  28.08 
 
 		 597 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  30.21 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.99 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 407 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  38.33 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.99 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.92 
 
 		 396 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  27.52 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  27.4 
 
 		 601 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>