More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0719 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  60.4 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  54.63 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.4 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  45.63 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  44.34 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  44.95 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  49.02 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  50 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0276  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000858967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  40.38 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  44 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  45.79 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1237  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288274  hitchhiker  0.00079721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  41.51 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>