249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_523 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_523  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  192  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00295691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0584  hypothetical protein  95.96 
 
 		 99 aa  188  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.992703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0558  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  183  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.611385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  36.08 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  35.05 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  40.51 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  34.04 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  32.99 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  32.29 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  31.25 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  32.65 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  34.74 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  29.9 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  32.29 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  29.9 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  29.59 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  32.99 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.68 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  31.63 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  31.63 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  31.63 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  31.63 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  27.55 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  27.55 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  29.9 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  27.84 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  32.63 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  32.58 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  30.61 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  30.21 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  30.53 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  31.63 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  32.29 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  24.14 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  25.77 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  26.53 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  28.72 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  32.58 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  28.26 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  29.17 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  30.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  30.53 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  34.18 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  37.35 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  29.47 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  30.38 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  28.42 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  30.39 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  34.74 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  28.42 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2609  hypothetical protein  28.57 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  31.63 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  30.53 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  29.47 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  26.09 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  30.34 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  28.72 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  28.72 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  31.63 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  26.26 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  28.42 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>