More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0086 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  82.86 
 
 		 105 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  80.19 
 
 		 106 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  93.62 
 
 		 106 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  91.49 
 
 		 106 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  81.91 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  79.79 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  67.62 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  55.24 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  59.05 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  56.19 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  58.1 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  62 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  59.22 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  61 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  61 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  51 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  54.29 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  52.38 
 
 		 107 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  57 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  58.49 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4056  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  53 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  56.6 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  56.6 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  51.46 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  52 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  53.92 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  53.92 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  53.92 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  46.94 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  53 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  49.49 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  49.51 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  52.94 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  51 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  53.47 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  51 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  52.48 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  52.08 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  45 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  51 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  49 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  46 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  43.69 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  47 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1358  hypothetical protein  55.43 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  48 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  46.94 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>