288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1358 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  213  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  71.17 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  63.96 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  53.61 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  53.61 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  53.61 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  50.96 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  50.52 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  45.37 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  53.4 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  53.61 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  53.61 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  51.55 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  53.61 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  49.12 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  49.12 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  49.04 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  52.58 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  50.52 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  49.48 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0086  hypothetical protein  59.52 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.643504  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  47.37 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  48.45 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  50.52 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  47.42 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  48.45 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  48.19 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  49.48 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  43.52 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0463  hypothetical protein  53.57 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0620  hypothetical protein  55.95 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.961902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  42.59 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  42.59 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0368  hypothetical protein  51.09 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0667  hypothetical protein  59.52 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  46.39 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.84 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1327  hypothetical protein  44.76 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  47.42 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  45.36 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  43.4 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  42.27 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  43.3 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  42 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  43.3 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  43.43 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  42.71 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  42.42 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  42.42 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  47.96 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  43.3 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>