More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2265 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  100 
 
 		 820 aa  1691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  68.29 
 
 		 823 aa  1172    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 958 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 958 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 958 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  43.19 
 
 		 958 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 958 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  43.04 
 
 		 958 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  43.29 
 
 		 955 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 959 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 958 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  42.98 
 
 		 939 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  42.9 
 
 		 958 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  43.87 
 
 		 946 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  43.23 
 
 		 947 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  42.84 
 
 		 939 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  42.92 
 
 		 956 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  43.1 
 
 		 957 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  43.93 
 
 		 945 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  43.38 
 
 		 927 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1118  excinuclease ABC subunit A  41.89 
 
 		 996 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  40.35 
 
 		 957 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  40.23 
 
 		 957 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  40.85 
 
 		 942 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  42.28 
 
 		 954 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  43.81 
 
 		 971 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5040  excinuclease ABC, A subunit  41.79 
 
 		 971 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  41.72 
 
 		 952 aa  536  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  40.77 
 
 		 943 aa  539  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  41.49 
 
 		 944 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  41.03 
 
 		 988 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  42.16 
 
 		 942 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  42.27 
 
 		 946 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.02 
 
 		 838 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  42.61 
 
 		 975 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  42.26 
 
 		 941 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06520  excinuclease ABC subunit A  41.67 
 
 		 944 aa  532  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3281  excinuclease ABC, A subunit  41.86 
 
 		 950 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  40.4 
 
 		 946 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  39.97 
 
 		 947 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  40.93 
 
 		 967 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19021  excinuclease ABC subunit A  41.02 
 
 		 967 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  41.68 
 
 		 962 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.9 
 
 		 838 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1194  excinuclease ABC subunit A  41.09 
 
 		 932 aa  528  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  39.44 
 
 		 942 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  41.09 
 
 		 988 aa  525  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2694  excinuclease ABC, A subunit  41.88 
 
 		 942 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  41.69 
 
 		 979 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1007  excinuclease ABC, A subunit  42.01 
 
 		 958 aa  525  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  41.8 
 
 		 937 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2142  excinuclease ABC, A subunit  42.47 
 
 		 949 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.364139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  41.91 
 
 		 987 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.89 
 
 		 954 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 966 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 954 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  41.87 
 
 		 946 aa  524  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2295  excinuclease ABC, A subunit  42.11 
 
 		 949 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.96 
 
 		 843 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0866  excinuclease ABC subunit A  40.66 
 
 		 945 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.7 
 
 		 827 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  39.68 
 
 		 947 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 		 965 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09180  excinuclease ABC subunit A  40.66 
 
 		 945 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  41.44 
 
 		 963 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  41.16 
 
 		 967 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  41.44 
 
 		 946 aa  522  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4734  excinuclease ABC, A subunit  42.07 
 
 		 940 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0654  excinuclease ABC, A subunit  39.77 
 
 		 992 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  35.82 
 
 		 844 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4520  excinuclease ABC subunit A  40.2 
 
 		 961 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.98 
 
 		 861 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  41.43 
 
 		 945 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  41.44 
 
 		 931 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  40.06 
 
 		 944 aa  522  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  42.42 
 
 		 942 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  39.86 
 
 		 966 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1192  excinuclease ABC subunit A  41.15 
 
 		 970 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0448  excinuclease ABC subunit A  41.44 
 
 		 957 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.63 
 
 		 850 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  40.17 
 
 		 962 aa  522  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  39.8 
 
 		 944 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  39.68 
 
 		 939 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  42.13 
 
 		 946 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.52 
 
 		 877 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  40.31 
 
 		 1004 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  40.66 
 
 		 977 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.198775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  34.52 
 
 		 838 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  39.6 
 
 		 951 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  41.61 
 
 		 976 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0516  excinuclease ABC subunit A  39.91 
 
 		 944 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567244  normal  0.0841787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  41.45 
 
 		 1004 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1528  excinuclease ABC subunit A  41.07 
 
 		 965 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.890561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  41.98 
 
 		 916 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3515  excinuclease ABC, A subunit  40.7 
 
 		 954 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000620303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  40.79 
 
 		 1019 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0512  excinuclease ABC subunit A  39.77 
 
 		 944 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  41.77 
 
 		 1002 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2183  excinuclease ABC, A subunit  41.68 
 
 		 945 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.666287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>