More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1849 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 62 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  53.7 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  63.83 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  50.88 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  61.11 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  52.46 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  55.77 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  51.79 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  50.91 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  53.7 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  48.33 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  57.41 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  53.7 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>