243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0661 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 831 aa  1651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  44.49 
 
 		 892 aa  594  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.04 
 
 		 892 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.26 
 
 		 929 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.98 
 
 		 933 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.24 
 
 		 952 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.73 
 
 		 938 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.41 
 
 		 906 aa  489  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 931 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 		 915 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.53 
 
 		 954 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.75 
 
 		 876 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.19 
 
 		 926 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.28 
 
 		 939 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 		 881 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.7 
 
 		 889 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 946 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 889 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.59 
 
 		 887 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 946 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 889 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 889 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 946 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.4 
 
 		 1002 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 		 985 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.23 
 
 		 1001 aa  446  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 		 887 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 889 aa  446  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 		 889 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 878 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.94 
 
 		 898 aa  442  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 		 929 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 879 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 		 937 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 		 954 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.14 
 
 		 981 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.38 
 
 		 900 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 		 878 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.7 
 
 		 881 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.48 
 
 		 946 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 942 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 878 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.58 
 
 		 928 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.57 
 
 		 920 aa  432  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 950 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 		 878 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 994 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 		 926 aa  432  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.26 
 
 		 878 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.32 
 
 		 896 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 972 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 		 1009 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 		 876 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 1008 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 		 879 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.87 
 
 		 929 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 		 937 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.59 
 
 		 938 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 		 994 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.79 
 
 		 998 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.08 
 
 		 932 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 		 1009 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 883 aa  429  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 1002 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 998 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.96 
 
 		 880 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.98 
 
 		 995 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.49 
 
 		 1004 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 1088 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 896 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 		 936 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 		 878 aa  426  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 879 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.36 
 
 		 951 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.45 
 
 		 989 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.13 
 
 		 989 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.97 
 
 		 878 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.74 
 
 		 878 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.75 
 
 		 926 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.81 
 
 		 945 aa  422  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 1018 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 994 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 994 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 1024 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 994 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 		 989 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.11 
 
 		 937 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 887 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>