40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5143 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  40.09 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  34.76 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  36.65 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  30.32 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  30.06 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  27.34 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  28.91 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.86 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  30.58 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  29.31 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  26.54 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  28.87 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1227  hypothetical protein  22.96 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.219903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  29.6 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  25.64 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.27 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  28.33 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  28.23 
 
 		 335 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  26.96 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  24 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  27.69 
 
 		 480 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  21.97 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  27.42 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  23.9 
 
 		 378 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  26.96 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  23.21 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  24.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  25.69 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  22.05 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  26.4 
 
 		 253 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>