More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4878 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
863 aa  1787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  39.88 
 
 
827 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.27 
 
 
845 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  37.37 
 
 
829 aa  561  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.78 
 
 
834 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  38.72 
 
 
822 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.83 
 
 
905 aa  323  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.49 
 
 
865 aa  309  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.16 
 
 
824 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.2 
 
 
821 aa  306  9.000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.23 
 
 
823 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.03 
 
 
858 aa  302  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.21 
 
 
865 aa  296  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.81 
 
 
857 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.81 
 
 
857 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.88 
 
 
822 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.9 
 
 
866 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.97 
 
 
846 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.91 
 
 
860 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.02 
 
 
835 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.57 
 
 
823 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.98 
 
 
768 aa  231  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.8 
 
 
673 aa  198  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.11 
 
 
492 aa  170  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.23 
 
 
551 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.67 
 
 
499 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  33.12 
 
 
509 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.64 
 
 
517 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.44 
 
 
538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  30.75 
 
 
688 aa  157  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  31.75 
 
 
852 aa  157  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  30.38 
 
 
853 aa  156  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  27.95 
 
 
485 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.75 
 
 
686 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.92 
 
 
503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.39 
 
 
470 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.19 
 
 
442 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.19 
 
 
442 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  31.33 
 
 
867 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  31.33 
 
 
867 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.46 
 
 
506 aa  154  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.24 
 
 
471 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.29 
 
 
442 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  30.84 
 
 
867 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  28.32 
 
 
851 aa  151  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  28.21 
 
 
881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.63 
 
 
687 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.11 
 
 
877 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  30.36 
 
 
848 aa  147  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.32 
 
 
455 aa  147  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  30.59 
 
 
861 aa  147  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  30.56 
 
 
844 aa  147  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.53 
 
 
852 aa  147  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  31.44 
 
 
889 aa  147  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  30.03 
 
 
446 aa  146  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  31.02 
 
 
856 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.94 
 
 
442 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  28.92 
 
 
848 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  31.09 
 
 
869 aa  145  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  28.27 
 
 
855 aa  144  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  30.81 
 
 
844 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.14 
 
 
448 aa  142  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  31.51 
 
 
844 aa  140  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0605  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.73 
 
 
456 aa  140  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.01 
 
 
738 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.01 
 
 
738 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  27.13 
 
 
895 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  30.31 
 
 
882 aa  139  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  30.67 
 
 
861 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  27.45 
 
 
882 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1929  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.56 
 
 
536 aa  137  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.66 
 
 
859 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  33.12 
 
 
857 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  30.09 
 
 
862 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  31.71 
 
 
849 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.8 
 
 
460 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00175838  hitchhiker  0.0000306321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.34 
 
 
527 aa  135  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  26.72 
 
 
848 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  27.33 
 
 
906 aa  134  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.42 
 
 
458 aa  134  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  29.13 
 
 
846 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.98 
 
 
932 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  29.67 
 
 
854 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  29.43 
 
 
855 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  31.01 
 
 
853 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  27.85 
 
 
862 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14450  aminopeptidase N  28.75 
 
 
446 aa  131  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  29.23 
 
 
846 aa  131  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.84 
 
 
933 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.23 
 
 
785 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  29.56 
 
 
905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  28.3 
 
 
858 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  26.24 
 
 
849 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  28.91 
 
 
851 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  28.61 
 
 
850 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.6 
 
 
932 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  31.03 
 
 
877 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  26.67 
 
 
850 aa  129  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.49 
 
 
778 aa  128  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.79 
 
 
784 aa  127  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>