More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4825 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.2 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  40.65 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.72 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  38.94 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  39.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  39.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.65 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.81 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  37.32 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.8 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.16 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.29 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.98 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.83 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.75 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.85 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  40.38 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.46 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.44 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.13 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  41.67 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.5 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.5 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  36.54 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.05 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  36.67 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.05 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  38.05 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  37.56 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  37.68 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 396 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.74 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  34.9 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.22 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.02 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.65 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.48 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  31.02 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  31.02 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  36.17 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  33.64 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.56 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.11 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.25 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.77 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.23 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.7 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  34.41 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.77 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.83 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.56 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.46 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  30.73 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.02 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  28.83 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  32.42 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.2 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  30.59 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1573  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670571  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.6 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.59 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.96 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.6 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.23 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 728 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.54 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  33 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  34.57 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  33.86 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>