More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3632 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1509  Transketolase domain protein  54.2 
 
 		 807 aa  929    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277218  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4914  Transketolase domain protein  69.04 
 
 		 801 aa  1174    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10513  (pyruvate) Oxoisovalerate Dehydrogenase Alpha and Beta Fusion  53.69 
 
 		 801 aa  915    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3632  Transketolase domain protein  100 
 
 		 804 aa  1671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0324  hypothetical protein  58.59 
 
 		 792 aa  1005    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1992  transketolase  56.36 
 
 		 802 aa  977    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1648  Transketolase domain protein  54.07 
 
 		 799 aa  911    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2105  Transketolase domain protein  53.67 
 
 		 781 aa  912    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4512  transketolase domain-containing protein  53.04 
 
 		 804 aa  893    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  28.71 
 
 		 710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  37.35 
 
 		 332 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  35.03 
 
 		 341 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  36.73 
 
 		 332 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  36.25 
 
 		 330 aa  189  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  36.53 
 
 		 337 aa  188  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  37.35 
 
 		 338 aa  188  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.95 
 
 		 337 aa  185  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  33.95 
 
 		 337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  35.08 
 
 		 337 aa  184  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  33.95 
 
 		 337 aa  184  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 334 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.46 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  34.56 
 
 		 347 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  35.67 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  25.74 
 
 		 693 aa  180  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  35.17 
 
 		 339 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  34.47 
 
 		 327 aa  179  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  34.47 
 
 		 327 aa  179  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  34.45 
 
 		 324 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  35.17 
 
 		 352 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  34.86 
 
 		 352 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  34.67 
 
 		 327 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  35.28 
 
 		 347 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  35.28 
 
 		 347 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.22 
 
 		 351 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  26.58 
 
 		 823 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  32.28 
 
 		 736 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  34.15 
 
 		 320 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  33.33 
 
 		 345 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  34.6 
 
 		 325 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.37 
 
 		 336 aa  175  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  34.94 
 
 		 325 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  34.76 
 
 		 324 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  34.76 
 
 		 324 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  35.78 
 
 		 322 aa  174  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3743  transketolase central region  33.94 
 
 		 352 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.530888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.45 
 
 		 324 aa  174  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2993  2-oxoisovalerate dehydrogenase (beta subunit)  32.74 
 
 		 350 aa  173  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.54 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  33.33 
 
 		 325 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35520  2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta  32.74 
 
 		 350 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0580998  hitchhiker  0.00209483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.88 
 
 		 346 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.03 
 
 		 337 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  32.61 
 
 		 332 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  34.74 
 
 		 326 aa  172  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  34.77 
 
 		 346 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  34.77 
 
 		 346 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  32.62 
 
 		 328 aa  172  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  34.77 
 
 		 346 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.23 
 
 		 325 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  33.54 
 
 		 325 aa  171  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  32.92 
 
 		 325 aa  170  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.92 
 
 		 325 aa  170  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1011  Transketolase central region  33.64 
 
 		 337 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  33.43 
 
 		 337 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  33.43 
 
 		 343 aa  168  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  34.15 
 
 		 324 aa  168  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  33.54 
 
 		 327 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  32.59 
 
 		 335 aa  168  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  33.33 
 
 		 330 aa  168  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.99 
 
 		 327 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  32.21 
 
 		 327 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  30 
 
 		 324 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  32.84 
 
 		 327 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  34.08 
 
 		 326 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  32.62 
 
 		 352 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  32.62 
 
 		 327 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  37.6 
 
 		 342 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  34.08 
 
 		 326 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  35.9 
 
 		 326 aa  165  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  36.01 
 
 		 326 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.68 
 
 		 327 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.68 
 
 		 327 aa  164  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.13 
 
 		 337 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  35.47 
 
 		 327 aa  164  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  35.47 
 
 		 327 aa  164  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  32.82 
 
 		 326 aa  163  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  33.97 
 
 		 324 aa  163  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  32.48 
 
 		 325 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>