50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1648 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  62.11 
 
 
164 aa  180  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  50.31 
 
 
177 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  53.46 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  55.35 
 
 
172 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  51.57 
 
 
166 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  51.57 
 
 
166 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  52.17 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  49.4 
 
 
176 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  57.72 
 
 
193 aa  148  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  47.31 
 
 
166 aa  144  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  52.12 
 
 
169 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  51.63 
 
 
173 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  45.24 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  51.43 
 
 
179 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  43.4 
 
 
301 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  53.85 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  48.5 
 
 
232 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  48.5 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  45.09 
 
 
182 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  54.55 
 
 
165 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  43.59 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  43.59 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  42.95 
 
 
168 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  46.47 
 
 
206 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  121  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  43.35 
 
 
175 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  49.11 
 
 
174 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  41.57 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  41.88 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  42.65 
 
 
172 aa  117  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  46.71 
 
 
170 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  48.5 
 
 
173 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  59.34 
 
 
91 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  37.65 
 
 
168 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  40.88 
 
 
162 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  31.45 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  40.72 
 
 
249 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  41.92 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  32.43 
 
 
197 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  40.74 
 
 
163 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  42.5 
 
 
163 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  29.81 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  36.51 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  31.36 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  34.15 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  29.6 
 
 
255 aa  48.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0609  membrane protein-like protein  26.5 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547823  normal  0.905426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  51.06 
 
 
56 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>