43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1318 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 427 aa  851    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  45.99 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  46.25 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  46.73 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  34.86 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  33.49 
 
 		 410 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  41.06 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  33.89 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  34.45 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  33.73 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 		 395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  30.4 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  30.1 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  29.51 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  29.2 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  35.35 
 
 		 609 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  29.44 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.78 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.72 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  32.46 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.27 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.18 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.69 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 700 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  22.61 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  25.17 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.68 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  27.78 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  21.46 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.03 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1676  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.14 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  32.11 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 873 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.4 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.37 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.71 
 
 		 422 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.62 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  33.04 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>