30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3760 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3554  hypothetical protein  48.42 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000322896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  37.72 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  31.45 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  32.06 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  32.82 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  28.81 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  32.09 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  26.67 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  27.69 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  24 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  29.85 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  25.83 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  28.35 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  25.86 
 
 		 138 aa  42  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  27.93 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  23.31 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  48.78 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  48.78 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  48.78 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  48.78 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  48.78 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.78 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  48.78 
 
 		 145 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>