72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3735 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3735  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0827  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 
264 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0238202  normal  0.253698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2582  hypothetical protein  39.03 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.148491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2007  hypothetical protein  40.15 
 
 
280 aa  201  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.513637  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3416  alpha/beta hydrolase fold  45.38 
 
 
268 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0981  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1177  hypothetical protein  33.59 
 
 
268 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0775  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
247 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.841147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  24.62 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  46.97 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  31.43 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  22.71 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  42 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
316 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  36.54 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  24.62 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0522  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.58 
 
 
241 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  40.68 
 
 
308 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.02 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.35 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  38 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  20.73 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.83 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  54.55 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.78 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
376 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  27.57 
 
 
317 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 
348 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
284 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
271 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>