More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3200 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
290 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.7 
 
 
301 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.16 
 
 
284 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  43.05 
 
 
282 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  43.48 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.83 
 
 
288 aa  232  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.77 
 
 
285 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.14 
 
 
289 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.57 
 
 
284 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.82 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.33 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.67 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.88 
 
 
283 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.6 
 
 
287 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  41.45 
 
 
285 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.15 
 
 
285 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.45 
 
 
293 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.02 
 
 
278 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.87 
 
 
285 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.57 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.23 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  40.26 
 
 
280 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 
283 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.94 
 
 
652 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
287 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.8 
 
 
283 aa  188  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.1 
 
 
276 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.01 
 
 
277 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.03 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.89 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
291 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  39.39 
 
 
268 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.86 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
287 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  30.35 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
289 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.84 
 
 
290 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.72 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 
282 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.97 
 
 
288 aa  125  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 
288 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  28.01 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.97 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
291 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 
287 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.98 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  30.39 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.67 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  27.59 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
288 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.34 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
291 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
296 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.32 
 
 
286 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
305 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
286 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  27.24 
 
 
288 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.39 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  31.3 
 
 
291 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.02 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.19 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.91 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 
473 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 
360 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.1 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.88 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.89 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  24.73 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.55 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.1 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.42 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  46.81 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  57.14 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  57.14 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.07 
 
 
370 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 
370 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  23.19 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  20.14 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2235  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  64.86 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0694102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  37.31 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  64.86 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  42.86 
 
 
272 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  54.35 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.38 
 
 
281 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.06 
 
 
612 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0148  chromosome partitioning ATPase  60.53 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0375765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>