211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2677 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  54.03 
 
 
970 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  100 
 
 
1046 aa  2146    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  51.69 
 
 
969 aa  965    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  49.9 
 
 
969 aa  891    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  35.06 
 
 
973 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  34.91 
 
 
973 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.68 
 
 
976 aa  1075    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  50.37 
 
 
968 aa  926    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  40.96 
 
 
986 aa  748    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  51 
 
 
968 aa  971    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  61.94 
 
 
964 aa  1192    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  61.82 
 
 
968 aa  1179    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  48.46 
 
 
979 aa  920    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  49.95 
 
 
968 aa  953    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.38 
 
 
992 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  34.72 
 
 
985 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.42 
 
 
987 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  34.56 
 
 
972 aa  477  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  33.3 
 
 
999 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.3 
 
 
985 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  34.15 
 
 
1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  30.99 
 
 
987 aa  469  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  33.4 
 
 
970 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  30 
 
 
1017 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.31 
 
 
973 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  31.54 
 
 
1010 aa  459  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  31.15 
 
 
983 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.13 
 
 
972 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  30.35 
 
 
970 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  32.11 
 
 
983 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.99 
 
 
967 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  33.02 
 
 
974 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  29.05 
 
 
949 aa  429  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  27.16 
 
 
971 aa  427  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  30.37 
 
 
975 aa  424  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  29.51 
 
 
1049 aa  380  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  27.96 
 
 
1024 aa  353  7e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  28.32 
 
 
1025 aa  353  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.68 
 
 
1032 aa  351  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  23.81 
 
 
1137 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  25.73 
 
 
1046 aa  293  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  26.04 
 
 
1049 aa  124  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  22.05 
 
 
1054 aa  108  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  24.21 
 
 
1057 aa  104  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.21 
 
 
945 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 
937 aa  77.4  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.33 
 
 
896 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  24.58 
 
 
419 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.77 
 
 
878 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.04 
 
 
419 aa  64.7  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  26.87 
 
 
928 aa  63.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 
439 aa  60.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  24.28 
 
 
419 aa  60.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  23.24 
 
 
919 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  28.42 
 
 
949 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  26.14 
 
 
903 aa  57.4  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 
422 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.71 
 
 
921 aa  57.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  24.87 
 
 
419 aa  56.2  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 
424 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  23.41 
 
 
427 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  23.41 
 
 
427 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  22.89 
 
 
424 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  22.89 
 
 
424 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  25 
 
 
461 aa  55.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
443 aa  55.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  21.63 
 
 
426 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.81 
 
 
934 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  25.8 
 
 
469 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  24.14 
 
 
431 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  26.87 
 
 
647 aa  54.7  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  22.46 
 
 
431 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.81 
 
 
942 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  24.02 
 
 
454 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  24.55 
 
 
435 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  22.93 
 
 
418 aa  53.5  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1462  peptidase M16 domain protein  24.31 
 
 
413 aa  53.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287908  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  29.89 
 
 
912 aa  53.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  20.73 
 
 
431 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  23.56 
 
 
962 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.57 
 
 
939 aa  52.4  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 
879 aa  52  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  27.27 
 
 
448 aa  52.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  21.84 
 
 
421 aa  52  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  24.18 
 
 
513 aa  52  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  26.2 
 
 
441 aa  52  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  25.43 
 
 
460 aa  52  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  25.43 
 
 
460 aa  52  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  25.82 
 
 
452 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4588  processing peptidase  25.89 
 
 
417 aa  51.6  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.17 
 
 
912 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1339  peptidase M16 domain-containing protein  27.49 
 
 
428 aa  51.2  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>