30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2535 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  51.52 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  52.78 
 
 
247 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  42.52 
 
 
247 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  44.71 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  39.11 
 
 
245 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  38.87 
 
 
249 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  39.04 
 
 
244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  37.3 
 
 
250 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  34.78 
 
 
255 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 
243 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  33.73 
 
 
247 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  35.69 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  29.67 
 
 
247 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  32.7 
 
 
248 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  30.08 
 
 
247 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  31.22 
 
 
237 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  33.07 
 
 
247 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  41.1 
 
 
243 aa  96.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  34.83 
 
 
236 aa  96.3  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  28.4 
 
 
253 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  30 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  33.8 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  31.91 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  29.91 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  32.67 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  37.7 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>