More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1627 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  68.56 
 
 		 236 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  64.78 
 
 		 258 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  64.83 
 
 		 242 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  51.82 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  51.82 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  53.81 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  50.61 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  47.6 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  45.82 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  45.82 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  45.42 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  45.82 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  48.35 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  48.35 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  45.42 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  45.42 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  45.42 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  46.72 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  48.13 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  48.13 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  47.72 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  41.27 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  45.08 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  41.5 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  34.85 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.29 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  36.04 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.19 
 
 		 490 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  37.24 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  37.16 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  30.92 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  36.41 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  30.47 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  38.29 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  37.93 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  30.9 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  34.21 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  35 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  35.97 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  35.97 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  37.17 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  37.71 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  34.3 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.57 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.56 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  35.78 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  32.47 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  36.36 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  33.91 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7397  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.57 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  34.87 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.78 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  40.61 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  34.55 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  33.47 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  33.47 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  31.22 
 
 		 409 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  37.95 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.01 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.01 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  36.29 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  34.11 
 
 		 384 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  39.67 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.13 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  35.8 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  36.36 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  35.83 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  37.1 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  36.73 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>