17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3661 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  57.5 
 
 		 133 aa  154  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  39.64 
 
 		 130 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  38.74 
 
 		 130 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.44 
 
 		 122 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  33.94 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  34.18 
 
 		 645 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03109  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  45.1  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.042332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  25 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  28.32 
 
 		 662 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>