25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0870 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  100 
 
 
448 aa  923    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  61.69 
 
 
449 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  62.58 
 
 
448 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  60.79 
 
 
456 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  59.91 
 
 
457 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  48.8 
 
 
455 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  38.95 
 
 
436 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  32.49 
 
 
426 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  31.13 
 
 
430 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  32.36 
 
 
438 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  32.36 
 
 
438 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  24.31 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25.89 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  25.56 
 
 
414 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  31.45 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  29.38 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.88 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  33.93 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  31.52 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  31.03 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  24.62 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  25.83 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.97 
 
 
405 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  23.39 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  22.45 
 
 
433 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>