More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2819 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  72.54 
 
 		 448 aa  700    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  67.64 
 
 		 449 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  65.25 
 
 		 447 aa  648    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  65.47 
 
 		 447 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 448 aa  936    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  62.36 
 
 		 443 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  63.3 
 
 		 444 aa  595  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  60.91 
 
 		 446 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  59.68 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  59.68 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  58.76 
 
 		 443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  57.18 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  55.45 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  55.84 
 
 		 443 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  52.89 
 
 		 452 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  54.1 
 
 		 453 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  54.2 
 
 		 445 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  54.48 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  52.22 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  51.92 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  55.17 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  52.99 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  52.63 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  51.24 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  54.69 
 
 		 446 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  54.69 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  52.58 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  52.48 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  52.4 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  51.93 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  53.35 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  52.58 
 
 		 447 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  53.44 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  53.76 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  51.47 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  54.23 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  52.37 
 
 		 445 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  54.69 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  54.69 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  53.42 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  54.69 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  53.44 
 
 		 453 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  54.77 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  52.4 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  52.57 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  51.91 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  52.4 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  51.72 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  49.66 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  50.91 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  52.05 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  48.97 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  48.85 
 
 		 443 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  48.29 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  47.53 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  48.85 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  47.95 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  49.09 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  46.22 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  48.86 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  47.25 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  47.27 
 
 		 440 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  50.45 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  47.06 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  45.27 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  47.03 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  47.03 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  47.15 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  47.03 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  47.32 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  47.85 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  46.8 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  48.28 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  46.74 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  46.35 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  46.12 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  47.39 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  48.42 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  47.61 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  49.3 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  47.52 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  46.45 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  45.12 
 
 		 445 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  46.35 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  46.91 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  47.03 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>