83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2240 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  517  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  52.63 
 
 
266 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0933  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  51.25 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2468  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  47.41 
 
 
265 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.81 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  36.3 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.81 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  36.3 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  36.3 
 
 
255 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.37 
 
 
284 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.26 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  33.53 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.43 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.95 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  26.32 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  26.32 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.68 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.69 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.23 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  25.79 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  25.79 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  25.79 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.85 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.03 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.37 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  30.77 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.32 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.05 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.56 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.56 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.48 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.56 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  38.55 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  30.13 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  30.19 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  30.19 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.19 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.19 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.19 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.57 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.87 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  39.51 
 
 
316 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  38.52 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  34.32 
 
 
289 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.72 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  39.51 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  37.63 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  37.63 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  36.56 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  36.56 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  24.81 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  36.56 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  23.62 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.14 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.85 
 
 
275 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  26.14 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  26.14 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  23.64 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.77 
 
 
287 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  23.64 
 
 
257 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.48 
 
 
315 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.77 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  23.64 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.67 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.67 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  29.67 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  47.62 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.67 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.67 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.91 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.91 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  31.91 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.37 
 
 
315 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>