44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0731 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0731  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 570 aa  1130    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4251  TolB domain-containing protein  25.25 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4089  TolB domain-containing protein  25.25 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00893899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4100  TolB domain-containing protein  24.28 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.417738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4583  TolB domain-containing protein  25.25 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4487  tolB domain protein  24.28 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4435  tolB domain protein  25.25 
 
 		 410 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4436  TolB domain-containing protein  25.68 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0762  tolB domain protein  24.81 
 
 		 410 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00173882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  25.75 
 
 		 574 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4474  tolB domain protein  24.3 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0574619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4202  hypothetical protein  23.74 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  27.57 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  21.23 
 
 		 1069 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  20.52 
 
 		 1060 aa  58.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  20.75 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  21.5 
 
 		 1081 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.53 
 
 		 1071 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  20.38 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  22.06 
 
 		 1062 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  28.57 
 
 		 1097 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.12 
 
 		 1090 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  33.03 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.24 
 
 		 840 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.15 
 
 		 660 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.41 
 
 		 697 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.14 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 969 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.24 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  20.33 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.51 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.1 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  19.78 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  22.42 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  20.09 
 
 		 1062 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  28.77 
 
 		 970 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  20.33 
 
 		 1062 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.15 
 
 		 717 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.12 
 
 		 750 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.55 
 
 		 454 aa  43.9  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  26.36 
 
 		 419 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  26.36 
 
 		 419 aa  43.5  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  19.78 
 
 		 1062 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>