22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3554 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  71.6 
 
 		 279 aa  341  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  67.73 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  33.88 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  33.2 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  31.95 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  33.03 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  32.52 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  32.52 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  32.38 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  30.05 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  24.22 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  30.96 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  27.09 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  28.5 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  23.79 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  22.98 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  23.67 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  26.04 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  25.63 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  24.64 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>