38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2709 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  56.41 
 
 
82 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  45.35 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  45.35 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  45.35 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  43.9 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  52.63 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  48.68 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  48.68 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  45.12 
 
 
87 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  47.5 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  44.74 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  38.75 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  51.72 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  36.84 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  36.71 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  33.72 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  32.89 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  36.25 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42161  predicted protein  31.17 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0806882  normal  0.994618 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  34.62 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  32.35 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  31.08 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  31.51 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  29.11 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  26.98 
 
 
82 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  29.51 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  24.36 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  33.9 
 
 
84 aa  42  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  31.25 
 
 
82 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  30.88 
 
 
115 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  24.36 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  28.21 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0219  phosphopantetheine-binding protein  34.29 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  28.38 
 
 
83 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  29.73 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  30.88 
 
 
77 aa  40  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>