More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2584 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
927 aa  1942    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2470  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  41.07 
 
 
972 aa  702    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0826406  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  41.82 
 
 
996 aa  705    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  40.67 
 
 
951 aa  681    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  35.22 
 
 
1027 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0194  molybdopterin oxidoreductase  31.48 
 
 
993 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  29.61 
 
 
962 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 
876 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2040  nitrate reductase, alpha subunit  30.67 
 
 
1222 aa  356  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4478  nitrate reductase, alpha subunit  31.71 
 
 
1242 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.397218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  29.78 
 
 
1227 aa  353  8.999999999999999e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  31.5 
 
 
1247 aa  350  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0192  nitrate reductase, alpha subunit  30.46 
 
 
1232 aa  350  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3138  nitrate reductase, alpha subunit  31.22 
 
 
1221 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000648615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  31.77 
 
 
1247 aa  349  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18720  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.46 
 
 
1256 aa  347  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0177  nitrate reductase, alpha subunit  30.58 
 
 
1232 aa  347  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.151114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  31.94 
 
 
1181 aa  341  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1824  nitrate reductase, alpha subunit  30.18 
 
 
1255 aa  340  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1559  nitrate reductase 1 subunit alpha  30.81 
 
 
1247 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.468525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1895  nitrate reductase 1, alpha subunit  30.56 
 
 
1247 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.5069  normal  0.259133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1959  nitrate reductase 1 subunit alpha  30.56 
 
 
1247 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1376  nitrate reductase 1, alpha subunit  30.56 
 
 
1247 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0697293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1205  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  31.39 
 
 
1216 aa  337  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1900  nitrate reductase 1, alpha subunit  30.56 
 
 
1247 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0962174  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1003  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30 
 
 
1252 aa  335  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251874  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.68 
 
 
1246 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5213  nitrate reductase subunit alpha  31.07 
 
 
1216 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598357  normal  0.703805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  30.04 
 
 
1247 aa  334  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1334  nitrate reductase, alpha subunit  29.99 
 
 
1247 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00293612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01202  nitrate reductase 1, alpha subunit  29.99 
 
 
1247 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1375  nitrate reductase, alpha subunit  29.99 
 
 
1247 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0266842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2399  nitrate reductase, alpha subunit  29.99 
 
 
1247 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000859704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1708  nitrate reductase 1, alpha subunit  29.99 
 
 
1247 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0699868  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  31.23 
 
 
1227 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1249  nitrate reductase, alpha subunit  30.21 
 
 
1274 aa  332  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  30.12 
 
 
1246 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2891  nitrate reductase, alpha subunit  30.24 
 
 
1254 aa  330  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1584  nitrate reductase, alpha subunit  30.12 
 
 
1246 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  30.12 
 
 
1246 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4429  nitrate reductase, alpha subunit  29.42 
 
 
1225 aa  330  8e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102054  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1763  nitrate reductase, alpha subunit  30.11 
 
 
1237 aa  330  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0373025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2803  nitrate reductase, alpha subunit  30.05 
 
 
1259 aa  330  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1765  nitrate reductase subunit alpha  30 
 
 
1246 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1694  nitrate reductase, alpha subunit  30.14 
 
 
1246 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  29.69 
 
 
1261 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1545  nitrate reductase, alpha subunit  30.07 
 
 
1267 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1235  nitrate reductase, alpha subunit  30.09 
 
 
1241 aa  327  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.177999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  29.61 
 
 
1232 aa  327  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1630  nitrate reductase, alpha subunit  29.95 
 
 
1267 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0122  nitrate reductase, alpha subunit  29.95 
 
 
1267 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5002  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.02 
 
 
1244 aa  327  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1234  nitrate reductase subunit alpha  29.57 
 
 
1261 aa  327  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.251816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2961  nitrate reductase, alpha subunit  30.96 
 
 
1229 aa  327  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2635  nitrate reductase, alpha subunit  30.6 
 
 
1251 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2315  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.24 
 
 
1247 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54501  normal  0.661113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.6 
 
 
1245 aa  325  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1771  nitrate reductase, alpha subunit  30.4 
 
 
1255 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.654752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1581  nitrate reductase, alpha subunit  30.4 
 
 
1244 aa  323  9.000000000000001e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0275  nitrate reductase, alpha subunit  29.77 
 
 
1254 aa  323  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1854  nitrate reductase, alpha subunit  29.62 
 
 
1341 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2074  respiratory nitrate reductase subunit alpha apoprotein  29.55 
 
 
1252 aa  322  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393838  normal  0.347657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2128  nitrate reductase, alpha subunit  29.64 
 
 
1250 aa  322  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5684  nitrate reductase, alpha subunit  29.64 
 
 
1252 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3592  nitrate reductase, alpha subunit  30.93 
 
 
1245 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.292866  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4669  nitrate reductase, alpha subunit  30.93 
 
 
1245 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00847712  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1731  nitrate reductase, alpha subunit  29.8 
 
 
1248 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2241  nitrate reductase, alpha subunit  29.8 
 
 
1241 aa  321  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3077  nitrate reductase, alpha subunit  29.8 
 
 
1241 aa  321  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.49471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1514  nitrate reductase, alpha subunit  29.8 
 
 
1241 aa  321  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4546  nitrate reductase, alpha subunit  30.25 
 
 
1233 aa  320  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159168  normal  0.282188 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2681  nitrate reductase, alpha subunit  29.68 
 
 
1241 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2757  nitrate reductase, alpha subunit  29.68 
 
 
1248 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  29.3 
 
 
1246 aa  320  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  29.3 
 
 
1246 aa  320  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  29.3 
 
 
1246 aa  320  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  29.3 
 
 
1256 aa  320  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2625  nitrate reductase, alpha subunit  29.68 
 
 
1241 aa  320  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  29.3 
 
 
1246 aa  320  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0299  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  29.64 
 
 
1254 aa  320  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2520  nitrate reductase, alpha subunit  30.15 
 
 
1251 aa  320  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.803235 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  29.34 
 
 
1246 aa  319  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  29.3 
 
 
1246 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1510  nitrate reductase, alpha subunit  29.71 
 
 
1244 aa  319  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0605  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.99 
 
 
1252 aa  319  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2156  nitrate reductase, alpha subunit  30.5 
 
 
1233 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0115159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  30.83 
 
 
1243 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3675  nitrate reductase, alpha subunit  30.08 
 
 
1225 aa  317  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381887  normal  0.0436101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.3 
 
 
1227 aa  317  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  29.4 
 
 
1252 aa  317  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.3 
 
 
1227 aa  317  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.3 
 
 
1227 aa  317  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3595  nitrate reductase, alpha subunit  29.56 
 
 
1201 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0172676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2792  nitrate reductase, alpha subunit  29.95 
 
 
1272 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  29.18 
 
 
1246 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0900  nitrate reductase, alpha subunit  29.63 
 
 
1225 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2564  nitrate reductase, alpha subunit  30.02 
 
 
1253 aa  314  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  29.27 
 
 
1260 aa  313  7.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.33 
 
 
871 aa  313  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  29.08 
 
 
1254 aa  308  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0614297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>