28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2392 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  937    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  56.45 
 
 		 570 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  43.16 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0807  hypothetical protein  28.9 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  27.36 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  27.68 
 
 		 602 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2689  SH3 type 3 domain-containing protein  23.95 
 
 		 676 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3222  hypothetical protein  26.88 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.258134  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  24.12 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  25.27 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4690  transcriptional regulator LysR  25.32 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.989962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2985  hypothetical protein  23.06 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0211  hypothetical protein  23.19 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.359203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  24.93 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0960  hypothetical protein  20 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1424  hypothetical protein  23.92 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.294946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0453  hypothetical protein  23.53 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2742  hypothetical protein  22.77 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  21.72 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1315  hypothetical protein  23.15 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.538272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0434  hypothetical protein  23.53 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  22.31 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  22.04 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0467  hypothetical protein  23.58 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1514  hypothetical protein  22.7 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0538542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1351  transcriptional regulator LysR  21.52 
 
 		 549 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000706303  hitchhiker  0.0000188076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2269  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  32.63 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2546  putative cox2 cytochrome oxidase subunit 2  32.63 
 
 		 677 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00554628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>