221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0233 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0753  phosphoglyceromutase  64.59 
 
 		 546 aa  732    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0233  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 546 aa  1122    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0072  phosphoglyceromutase  83.45 
 
 		 550 aa  959    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6862  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.49 
 
 		 552 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2410  phosphoglyceromutase  56.34 
 
 		 550 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  48.07 
 
 		 547 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  41 
 
 		 505 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  39.39 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  41.6 
 
 		 508 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  38.7 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  39.31 
 
 		 514 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  39.12 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  39.63 
 
 		 521 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  39.7 
 
 		 510 aa  346  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  38.48 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  39.7 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  39.66 
 
 		 510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  38.73 
 
 		 510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  39.35 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  39.02 
 
 		 517 aa  342  9e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  38.69 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  39.16 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  38.91 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  38.62 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  40.84 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 510 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  39.13 
 
 		 518 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  39.47 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  38.62 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  39.28 
 
 		 514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  40.65 
 
 		 511 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  38.1 
 
 		 511 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 		 518 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  38.07 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  38.97 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  38.43 
 
 		 512 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  39.7 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  39.09 
 
 		 510 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  37.9 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  39.7 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  41.52 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  40.46 
 
 		 511 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  38.52 
 
 		 514 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  37.73 
 
 		 512 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  37.45 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  39.12 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 		 514 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  39.12 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  38.78 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  39.24 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  37.4 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  38.55 
 
 		 514 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  38.25 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  38.55 
 
 		 514 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  38.55 
 
 		 514 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  38.33 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  39.16 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 		 514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 		 513 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  37.41 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  38.78 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 		 514 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  37.31 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 		 514 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  38.43 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  40.68 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  38.59 
 
 		 515 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 		 514 aa  323  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  38.08 
 
 		 513 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  36.71 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  36.6 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  39.2 
 
 		 511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  38.4 
 
 		 517 aa  321  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  37.74 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  38.59 
 
 		 515 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  38.45 
 
 		 513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  40.11 
 
 		 523 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  36.71 
 
 		 514 aa  320  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  39.85 
 
 		 521 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  37.78 
 
 		 552 aa  319  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  37.96 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  36.84 
 
 		 509 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  36.65 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  36.65 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  39.07 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  39.54 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>