More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5598 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  71.84 
 
 		 944 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  67.06 
 
 		 520 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  66.73 
 
 		 522 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  68.67 
 
 		 525 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  63.21 
 
 		 538 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 520 aa  1048    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  64.71 
 
 		 532 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  67.89 
 
 		 521 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  64.02 
 
 		 538 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  60.53 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  60.81 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  49.34 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 541 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 615 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  46.83 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  46.17 
 
 		 546 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  47.86 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  48.87 
 
 		 543 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  48.93 
 
 		 560 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  48.69 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.7 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  47.2 
 
 		 649 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  50.29 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  44.8 
 
 		 562 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  47.94 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  47.75 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 		 540 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  48.38 
 
 		 547 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  50.29 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  47.75 
 
 		 540 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 540 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  47.75 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  45.34 
 
 		 549 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  49.33 
 
 		 549 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  47.24 
 
 		 569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 		 547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  49.9 
 
 		 541 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 542 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  44.96 
 
 		 548 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 545 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  50.67 
 
 		 550 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  45.27 
 
 		 545 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  48.67 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  47.26 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  44.02 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  47.26 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  48.49 
 
 		 546 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  45.25 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 545 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  44.68 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  42.7 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 545 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  43.07 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  48.11 
 
 		 546 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  46.58 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  41.79 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  41.86 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  44.9 
 
 		 545 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  47.69 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  44.03 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  43.3 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  44.57 
 
 		 545 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  45.08 
 
 		 550 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  45.35 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  45.05 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  46.01 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  47.92 
 
 		 550 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  46.5 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  45.07 
 
 		 549 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 545 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  43.68 
 
 		 549 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>