25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5214 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  53.33 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  42.45 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  53.45 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  47.37 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  41.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  46.74 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  38.39 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  41.3 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  38.61 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  42.42 
 
 		 231 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  40.4 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  40.38 
 
 		 229 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  42.16 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  35.64 
 
 		 228 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  39.42 
 
 		 229 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  38.04 
 
 		 217 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  41 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  38.3 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  42.16 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  32.26 
 
 		 216 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.71 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  50 
 
 		 457 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  34.07 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  42.31 
 
 		 248 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>