More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3296 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  100 
 
 
254 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  63.54 
 
 
210 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  57.56 
 
 
227 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  61.98 
 
 
210 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  58.33 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  56.99 
 
 
237 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  60.11 
 
 
233 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  57.39 
 
 
214 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  54.64 
 
 
217 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  45.26 
 
 
226 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  45.26 
 
 
196 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  52.36 
 
 
224 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  44.74 
 
 
196 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  44.74 
 
 
226 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  44.21 
 
 
196 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  44.74 
 
 
196 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  43.68 
 
 
196 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  47.73 
 
 
221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  47.62 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  40.41 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  41.91 
 
 
285 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  52.5 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  46.03 
 
 
269 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  45.98 
 
 
455 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  51.37 
 
 
240 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  42.79 
 
 
264 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  39.9 
 
 
254 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  42.34 
 
 
264 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  50.65 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  43.39 
 
 
261 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  37.7 
 
 
201 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  32.28 
 
 
210 aa  121  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  33.68 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  32.64 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  33.68 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
255 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  33.16 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  33.16 
 
 
289 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  38.22 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  33.68 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  33.16 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  33.16 
 
 
289 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  37.7 
 
 
201 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  32.64 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  37.7 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  37.7 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  37.7 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  37.7 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  37.7 
 
 
201 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  44.79 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  39.38 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  31.98 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  37.37 
 
 
232 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.57 
 
 
1585 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  35.5 
 
 
426 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  32.81 
 
 
427 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.85 
 
 
2171 aa  90.1  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.17 
 
 
1156 aa  88.6  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  32.88 
 
 
490 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.3 
 
 
382 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  29.69 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 
344 aa  82  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  38.42 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  31.79 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  33.5 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 
1030 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.43 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.68 
 
 
157 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  32.82 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.89 
 
 
469 aa  77  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  29.31 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  31.16 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  35.36 
 
 
790 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.71 
 
 
2413 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  32.63 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  29.47 
 
 
1249 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  26.67 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  33.86 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.22 
 
 
1402 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.51 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  32.82 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  29.02 
 
 
1061 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.67 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.05 
 
 
762 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  29.8 
 
 
483 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  25.77 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  34.38 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  33.33 
 
 
870 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  30.92 
 
 
711 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  27.23 
 
 
1005 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  33.95 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30.49 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  36.22 
 
 
821 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  31.55 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  29.1 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  27.98 
 
 
954 aa  68.9  0.00000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  31.56 
 
 
395 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  27.96 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  38.41 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  31.03 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>