287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1384 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  94.57 
 
 		 92 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  93.48 
 
 		 92 aa  176  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  48.72 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  49.3 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  50.65 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  49.35 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  46.58 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  48.05 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  45.95 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  40.45 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  46.97 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  36.25 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  38.1 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  48 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  45.95 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  41.89 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  49.21 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  41.89 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  44.59 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  45.9 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  47.62 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.25 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  44 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  43.06 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  33.78 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>