22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4646 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  100 
 
 
147 aa  294  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  38.36 
 
 
151 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  39.39 
 
 
147 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  34.56 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  32.82 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  34.56 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  32.62 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  33.79 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  51.61 
 
 
62 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  31.85 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  34.62 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  28.36 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  29.41 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  27.13 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  28.99 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  28.08 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2575  PilT domain-containing protein  31.13 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0441  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 
151 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00845151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0239  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  27.5 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 
132 aa  40  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>