34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2452 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  100 
 
 
371 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  39.47 
 
 
382 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  37.5 
 
 
492 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  37.5 
 
 
492 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  37.5 
 
 
492 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  37.5 
 
 
492 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  37.5 
 
 
492 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  31.84 
 
 
371 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  42.08 
 
 
242 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  28.3 
 
 
388 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  33.46 
 
 
335 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  33.98 
 
 
344 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  31.8 
 
 
338 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  31.37 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  29.82 
 
 
345 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  29.82 
 
 
345 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  31.29 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  28.24 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  28.24 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  26.33 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  25.5 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  23.44 
 
 
301 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  23.44 
 
 
301 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  23.89 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  22.76 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.36 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 
249 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  28.47 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 
249 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.7 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.7 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.7 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.7 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>