20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2297 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2297  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1654  glycoside hydrolase family 24  56.86 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4318  glycoside hydrolase family protein  58.25 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1004  glycoside hydrolase family protein  60.12 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.974196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1543  glycoside hydrolase family 24  53.61 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3701  family 24 glycoside hydrolase  55.67 
 
 		 225 aa  208  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.653357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3944  muramidase (phage lambda lysozyme)-like  31.88 
 
 		 347 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1036  muramidase  33.09 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0937  muramidase  32.16 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0617276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0896  Lysozyme  30.67 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18641  endolysin  35.19 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1613  lysozyme  28.29 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.875614  hitchhiker  0.00136066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0304  phage lysozyme  30 
 
 		 158 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2206  lysozyme  27.19 
 
 		 630 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0209  hypothetical protein  29.88 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0202291  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2276  lysozyme  27.63 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00766878  hitchhiker  1.42848e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1848  putative bacteriophage endolysin protein  34.94 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15601  endolysin  30.09 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.719479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10030  cell lysis protein  29.17 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.011177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00935767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>