More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1557 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1557  ABC transporter related protein  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  57.26 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25830  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  53.09 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  52.28 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  54.51 
 
 		 344 aa  268  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  50.4 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 339 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  54.74 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  55.65 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 346 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  52.28 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  55.41 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 346 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  51.87 
 
 		 339 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 346 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  54.81 
 
 		 345 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 346 aa  261  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.68 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  260  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.68 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  52.81 
 
 		 343 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.98 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.55 
 
 		 343 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.68 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  52.34 
 
 		 365 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.84 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.11 
 
 		 343 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  54.55 
 
 		 351 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0483  ABC transporter related  52.81 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000112326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0496  ABC transporter related  52.81 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  52.59 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  53.45 
 
 		 385 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.81 
 
 		 343 aa  255  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.68 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  51 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  52.32 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  52.72 
 
 		 340 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  53.25 
 
 		 384 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  53.66 
 
 		 352 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 352 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.25 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.25 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  51.97 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 352 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 350 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  52.12 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  49 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  56.52 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  52.12 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.01 
 
 		 350 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.38 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  52.12 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  51.42 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.02 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  52.08 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  49.8 
 
 		 341 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.38 
 
 		 345 aa  248  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  51.01 
 
 		 391 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  47.39 
 
 		 339 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  52.12 
 
 		 369 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  48.58 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  53.48 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.68 
 
 		 344 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  49.78 
 
 		 392 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  51.87 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 366 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  53.48 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>