40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1887 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  39.36 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  37.72 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  35.03 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  34.43 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  37.23 
 
 
349 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  31.03 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0184  hypothetical protein  32.97 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  hitchhiker  0.00509511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  36.59 
 
 
350 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  33.64 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  32.33 
 
 
343 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  46.94 
 
 
296 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  35.26 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  28.17 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  29.11 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4307  hypothetical protein  31.58 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  32.58 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  30.67 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0994  KfrAs  34.21 
 
 
205 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0971877  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  44.9 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  31.71 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  33.64 
 
 
336 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1147  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.014535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0002  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0001  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0001  chromosome segregation ATPases  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1427  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1506  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0001  hypothetical protein  28.52 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  32.55 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  39.29 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  48.98 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  32.44 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1892  hypothetical protein  36.96 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  39.24 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  39.33 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  17.93 
 
 
1143 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  35 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  38.03 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>