More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0302 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
389 aa  781    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42 
 
 
393 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  38.28 
 
 
396 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.43 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.14 
 
 
393 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  40.65 
 
 
393 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.93 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.72 
 
 
392 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  40.36 
 
 
386 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  33.78 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  38.5 
 
 
393 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 
397 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  38.2 
 
 
393 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  40.48 
 
 
391 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
256 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  35.23 
 
 
390 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  35.88 
 
 
396 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
397 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  34.34 
 
 
269 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
264 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  33.85 
 
 
261 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  39.17 
 
 
377 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  36.68 
 
 
266 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
261 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  34.23 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
261 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
261 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
261 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  36.55 
 
 
261 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  34.23 
 
 
261 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
262 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  33.85 
 
 
267 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  34.96 
 
 
262 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.59 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.85 
 
 
261 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  33.98 
 
 
268 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
263 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  36.02 
 
 
260 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  33.08 
 
 
264 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
360 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  35.25 
 
 
263 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 
263 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  37.5 
 
 
263 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  34.88 
 
 
262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  35.92 
 
 
251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 
268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
261 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 
262 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
263 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 
263 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  34.48 
 
 
263 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 
263 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  32.31 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  31.92 
 
 
263 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 
260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  32.65 
 
 
258 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  34.39 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.13 
 
 
136 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.51 
 
 
132 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
271 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.8 
 
 
135 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.1 
 
 
134 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 
263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  32.08 
 
 
263 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.7 
 
 
265 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.21 
 
 
138 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.21 
 
 
138 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0833  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.92 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  33.72 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.97 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.75 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  32.63 
 
 
260 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  34.1 
 
 
265 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  32.45 
 
 
263 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  35.48 
 
 
260 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 
272 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  32.32 
 
 
265 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 
266 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.83 
 
 
263 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>