35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0206 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  100 
 
 
887 aa  1829    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  27.86 
 
 
907 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  27.89 
 
 
890 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  28.21 
 
 
890 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  28.75 
 
 
893 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  26.78 
 
 
890 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2245  hypothetical protein  91.94 
 
 
62 aa  126  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  20.86 
 
 
944 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.44 
 
 
875 aa  94  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  22.48 
 
 
945 aa  90.9  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  23.35 
 
 
925 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  21.94 
 
 
944 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  22.07 
 
 
944 aa  75.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  22.37 
 
 
944 aa  75.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  21.2 
 
 
893 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  23.23 
 
 
945 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  21.84 
 
 
655 aa  63.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  21.04 
 
 
949 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  23.31 
 
 
862 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  21.81 
 
 
780 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  21.4 
 
 
770 aa  55.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  23.17 
 
 
376 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01951  hypothetical protein  26.75 
 
 
252 aa  51.6  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  22.44 
 
 
1007 aa  51.2  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  24 
 
 
1082 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  23.37 
 
 
1072 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  24.24 
 
 
966 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  26.07 
 
 
853 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  25.68 
 
 
858 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  25.68 
 
 
858 aa  48.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  26.41 
 
 
1013 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25.68 
 
 
947 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25.68 
 
 
947 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  37.97 
 
 
880 aa  45.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25.68 
 
 
947 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>