64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0149 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  634    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  38.65 
 
 
301 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  38.16 
 
 
301 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  37.75 
 
 
302 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  35.9 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  30.17 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  31.31 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  30.1 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  32.53 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  28.57 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  31.94 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  31.95 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  27.81 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  31.6 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  28.52 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  28.15 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  30.1 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  25.27 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.9 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  29.19 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  29.07 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  29.19 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  29.83 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  29.43 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  29.43 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  31.56 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  29.43 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  31.56 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  28.43 
 
 
281 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  30.1 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  29.43 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
290 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  32.89 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  31.6 
 
 
278 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  30.32 
 
 
284 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  28.09 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  30.4 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  27.45 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  29.12 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  25.41 
 
 
290 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  32.31 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  28.96 
 
 
251 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  30.74 
 
 
278 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  28.28 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  28.28 
 
 
277 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  28.33 
 
 
277 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  31.45 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  27.74 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  27.55 
 
 
277 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  35.24 
 
 
290 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  26.01 
 
 
276 aa  45.8  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  28.26 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  27.04 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  34.95 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  29.49 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  27.24 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  28.32 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  25 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
273 aa  42.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>